Описывается модернизированный программно-математический комплекс для обработки результатов измерений с приемников сигналов космических навигационных систем. Разработано новое программное обеспечение, усовершенствована методика сравнения шкал времени территориально удаленных друг от друга эталонов времени и частоты. За счет применения несмещенной оценки математического ожидания по выборке результатов сравнений шкал времени удалось уменьшить погрешность усредненной оценки результатов измерений на интервале времени наблюдений.